我国从1989年开始实行肥料登记管理制度，同年农业部发布了《中华人民共和国农业部关于肥料、土壤调理剂及植物生长调节剂检验登记的暂行规定》（〔1989〕农（农）字第38号）。2000年颁布了《肥料登记管理办法》（农业部令32号），制定并发布了《肥料登记资料要求》，同时废止了1989年发布、1997年修订的《中华人民共和国农业部关于肥料、土壤调理剂及植物生长调节剂检验登记的暂行规定》，进一步健全了肥料登记管理制度。
随着现代农业的发展和行政体制改革的深入推进，肥料登记管理制度也面临着改革和发展的要求。按照国务院关于深化行政审批制度改革、进一步推动简政放权的部署安排。从2009年起，农业部连续下发了一系列登记管理的通知，具体内容如下：
由此可见，肥料登记管理是一个不断改进、完善的过程。管理方式的改进和完善，不仅促进了科学施肥发展，还简化了肥料登记程序，切实减轻了企业负担。因此，把握好政策的动态和发展趋势，对企业降低生产成本、提高市场竞争力具有至关重要的意义。
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